Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi, Meslek Yüksekokulu 1976 yılında Milli Eğitim Bakanlığı Erkek Teknik Öğretim Genel Müdürlüğüne bağlı olarak açılmış, Türkiye’de Akademi- Üniversite ayrımının ortadan kaldırıldığı 1981 yılından sonra 1982 yılında 41 sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile Anadolu Üniversitesine bağlanmıştır. Daha sonra 2007 yılında 5662 sayılı kanunla ve ek madde 81 ile ismi Meslek Yüksekokulu şeklinde değiştirilerek yeni kurulan Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi bünyesine katılmıştır.
Gıda İşleme Bölümü 1992 yılında Anadolu Üniversitesine bağlı olarak kurulmuştur. Daha sonra 2007 yılında 5662 sayılı Kanunla ve ek madde 81 ile ismi Meslek Yüksekokulu şeklinde değiştirilerek yeni kurulan Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi bünyesine katılmıştır.